Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brf2Q3UAW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brf2Q3UAW9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brf2Q3UAW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brf2Q3UAW9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brf2Q3UAW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms