Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3U6N9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3U6N9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q3U6N9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3U6N9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3U6N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U6N9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3U6N9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3U6N9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3U6N9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3U6N9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3U6N9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms