Protein–RNA interactions for Protein: Q3U132

Tespa1, Protein TESPA1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tespa1Q3U132 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tespa1Q3U132 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tespa1Q3U132 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tespa1Q3U132 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tespa1Q3U132 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tespa1Q3U132 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tespa1Q3U132 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tespa1Q3U132 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms