Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
D17Wsu92eQ3TT38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
D17Wsu92eQ3TT38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
D17Wsu92eQ3TT38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
D17Wsu92eQ3TT38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D17Wsu92eQ3TT38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
D17Wsu92eQ3TT38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms