Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3TQQ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3TQQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q3TQQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3TQQ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3TQQ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3TQQ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms