Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43aQ3TL54 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43aQ3TL54 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43aQ3TL54 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim43aQ3TL54 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43aQ3TL54 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms