Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2f1Q3THK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2f1Q3THK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf2f1Q3THK3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2f1Q3THK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2f1Q3THK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms