Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ1

Abraxas2, BRISC complex subunit Abraxas 2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas2Q3TCJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas2Q3TCJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas2Q3TCJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas2Q3TCJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas2Q3TCJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abraxas2Q3TCJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abraxas2Q3TCJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abraxas2Q3TCJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abraxas2Q3TCJ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abraxas2Q3TCJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Abraxas2Q3TCJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abraxas2Q3TCJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms