Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bpifa6Q0VGU8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bpifa6Q0VGU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bpifa6Q0VGU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bpifa6Q0VGU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Bpifa6Q0VGU8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bpifa6Q0VGU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bpifa6Q0VGU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Bpifa6Q0VGU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bpifa6Q0VGU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bpifa6Q0VGU8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bpifa6Q0VGU8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms