Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NeblQ0II04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NeblQ0II04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NeblQ0II04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NeblQ0II04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeblQ0II04 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeblQ0II04 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeblQ0II04 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeblQ0II04 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeblQ0II04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms