Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Znf541Q0GGX2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Znf541Q0GGX2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Znf541Q0GGX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Znf541Q0GGX2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Znf541Q0GGX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Znf541Q0GGX2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms