Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc7a1Q09143 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc7a1Q09143 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc7a1Q09143 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc7a1Q09143 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc7a1Q09143 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc7a1Q09143 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms