Protein–RNA interactions for Protein: Q08EG8

Krtap10-4, Keratin-associated protein 10-4, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap10-4Q08EG8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Krtap10-4Q08EG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Krtap10-4Q08EG8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Krtap10-4Q08EG8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Krtap10-4Q08EG8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Krtap10-4Q08EG8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krtap10-4Q08EG8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Krtap10-4Q08EG8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Krtap10-4Q08EG8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Krtap10-4Q08EG8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Krtap10-4Q08EG8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krtap10-4Q08EG8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms