Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prrx2Q06348 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prrx2Q06348 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prrx2Q06348 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prrx2Q06348 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms