Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SryQ05738 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SryQ05738 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SryQ05738 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SryQ05738 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SryQ05738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SryQ05738 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SryQ05738 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SryQ05738 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SryQ05738 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SryQ05738 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SryQ05738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SryQ05738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SryQ05738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SryQ05738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SryQ05738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SryQ05738 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SryQ05738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SryQ05738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SryQ05738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SryQ05738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SryQ05738 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SryQ05738 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SryQ05738 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SryQ05738 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SryQ05738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SryQ05738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SryQ05738 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SryQ05738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SryQ05738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SryQ05738 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SryQ05738 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SryQ05738 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SryQ05738 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SryQ05738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SryQ05738 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SryQ05738 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SryQ05738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SryQ05738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SryQ05738 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SryQ05738 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SryQ05738 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SryQ05738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SryQ05738 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SryQ05738 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SryQ05738 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SryQ05738 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SryQ05738 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SryQ05738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SryQ05738 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SryQ05738 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SryQ05738 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SryQ05738 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SryQ05738 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SryQ05738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SryQ05738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SryQ05738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SryQ05738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SryQ05738 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SryQ05738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SryQ05738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SryQ05738 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SryQ05738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SryQ05738 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SryQ05738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SryQ05738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SryQ05738 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SryQ05738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SryQ05738 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SryQ05738 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SryQ05738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SryQ05738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SryQ05738 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SryQ05738 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SryQ05738 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SryQ05738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SryQ05738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SryQ05738 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SryQ05738 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SryQ05738 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SryQ05738 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SryQ05738 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SryQ05738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SryQ05738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SryQ05738 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SryQ05738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SryQ05738 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SryQ05738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SryQ05738 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms