Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scg2Q03517 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scg2Q03517 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scg2Q03517 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Scg2Q03517 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Scg2Q03517 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scg2Q03517 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms