Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snai1Q02085 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snai1Q02085 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Snai1Q02085 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snai1Q02085 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snai1Q02085 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snai1Q02085 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snai1Q02085 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms