Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rsu1Q01730 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rsu1Q01730 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rsu1Q01730 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rsu1Q01730 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms