Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Top2aQ01320 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Top2aQ01320 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Top2aQ01320 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Top2aQ01320 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Top2aQ01320 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Top2aQ01320 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Top2aQ01320 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Top2aQ01320 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms