Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbp10Q000W5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gbp10Q000W5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp10Q000W5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms