Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VldlrP98156 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VldlrP98156 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VldlrP98156 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VldlrP98156 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VldlrP98156 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VldlrP98156 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VldlrP98156 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VldlrP98156 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VldlrP98156 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VldlrP98156 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VldlrP98156 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VldlrP98156 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VldlrP98156 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VldlrP98156 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms