Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lig3P97386 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig3P97386 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lig3P97386 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lig3P97386 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig3P97386 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig3P97386 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lig3P97386 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lig3P97386 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig3P97386 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig3P97386 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig3P97386 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig3P97386 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms