Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Meis3P97368 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Meis3P97368 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Meis3P97368 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Meis3P97368 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis3P97368 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis3P97368 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis3P97368 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Meis3P97368 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis3P97368 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Meis3P97368 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis3P97368 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Meis3P97368 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis3P97368 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Meis3P97368 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Meis3P97368 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Meis3P97368 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Meis3P97368 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Meis3P97368 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms