Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmsP97355 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmsP97355 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SmsP97355 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmsP97355 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmsP97355 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmsP97355 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmsP97355 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmsP97355 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmsP97355 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmsP97355 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmsP97355 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmsP97355 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmsP97355 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmsP97355 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmsP97355 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmsP97355 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SmsP97355 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmsP97355 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmsP97355 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmsP97355 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmsP97355 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmsP97355 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmsP97355 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmsP97355 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SmsP97355 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmsP97355 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmsP97355 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmsP97355 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SmsP97355 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SmsP97355 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmsP97355 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmsP97355 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmsP97355 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmsP97355 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmsP97355 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmsP97355 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmsP97355 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmsP97355 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmsP97355 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmsP97355 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmsP97355 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmsP97355 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmsP97355 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmsP97355 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmsP97355 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmsP97355 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmsP97355 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmsP97355 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmsP97355 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmsP97355 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmsP97355 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SmsP97355 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmsP97355 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmsP97355 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SmsP97355 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmsP97355 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmsP97355 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmsP97355 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmsP97355 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmsP97355 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmsP97355 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SmsP97355 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmsP97355 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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