Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CiitaP79621 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CiitaP79621 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CiitaP79621 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CiitaP79621 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CiitaP79621 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CiitaP79621 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CiitaP79621 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CiitaP79621 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CiitaP79621 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CiitaP79621 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms