Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp8a1P70704 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8a1P70704 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8a1P70704 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8a1P70704 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp8a1P70704 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms