Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxb13P70321 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hoxb13P70321 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxb13P70321 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb13P70321 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms