Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprvP70289 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PtprvP70289 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprvP70289 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprvP70289 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprvP70289 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprvP70289 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprvP70289 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprvP70289 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprvP70289 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprvP70289 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprvP70289 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprvP70289 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PtprvP70289 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PtprvP70289 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PtprvP70289 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PtprvP70289 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms