Protein–RNA interactions for Protein: P70160

Calca, Calcitonin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcaP70160 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CalcaP70160 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CalcaP70160 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CalcaP70160 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CalcaP70160 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CalcaP70160 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CalcaP70160 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CalcaP70160 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CalcaP70160 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CalcaP70160 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CalcaP70160 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CalcaP70160 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CalcaP70160 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CalcaP70160 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CalcaP70160 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CalcaP70160 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CalcaP70160 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CalcaP70160 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CalcaP70160 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CalcaP70160 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CalcaP70160 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CalcaP70160 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CalcaP70160 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CalcaP70160 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CalcaP70160 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms