Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl23P62830 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23P62830 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23P62830 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23P62830 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms