Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Polr2fP61219 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Polr2fP61219 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr2fP61219 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2fP61219 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2fP61219 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2fP61219 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms