Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrn4P59383 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrn4P59383 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrn4P59383 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn4P59383 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4P59383 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms