Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Csrnp3P59055 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Csrnp3P59055 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Csrnp3P59055 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Csrnp3P59055 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Csrnp3P59055 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Csrnp3P59055 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Csrnp3P59055 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms