Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubgcp3P58854 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tubgcp3P58854 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tubgcp3P58854 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tubgcp3P58854 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp3P58854 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp3P58854 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp3P58854 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp3P58854 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp3P58854 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp3P58854 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp3P58854 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms