Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CckbrP56481 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckbrP56481 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CckbrP56481 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CckbrP56481 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CckbrP56481 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CckbrP56481 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CckbrP56481 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CckbrP56481 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CckbrP56481 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CckbrP56481 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CckbrP56481 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CckbrP56481 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CckbrP56481 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CckbrP56481 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CckbrP56481 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CckbrP56481 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CckbrP56481 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CckbrP56481 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CckbrP56481 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CckbrP56481 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CckbrP56481 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CckbrP56481 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CckbrP56481 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CckbrP56481 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CckbrP56481 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CckbrP56481 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CckbrP56481 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CckbrP56481 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CckbrP56481 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms