Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrp1P56183 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrp1P56183 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rrp1P56183 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rrp1P56183 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rrp1P56183 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rrp1P56183 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rrp1P56183 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms