Protein–RNA interactions for Protein: P55302

Lrpap1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrpap1P55302 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrpap1P55302 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrpap1P55302 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrpap1P55302 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrpap1P55302 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrpap1P55302 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrpap1P55302 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms