Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bmp8bP55105 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bmp8bP55105 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bmp8bP55105 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmp8bP55105 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bmp8bP55105 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmp8bP55105 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms