Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pms2P54279 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pms2P54279 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pms2P54279 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pms2P54279 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pms2P54279 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pms2P54279 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pms2P54279 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pms2P54279 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pms2P54279 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pms2P54279 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pms2P54279 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pms2P54279 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pms2P54279 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pms2P54279 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pms2P54279 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pms2P54279 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pms2P54279 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pms2P54279 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms