Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fgd1P52734 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fgd1P52734 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fgd1P52734 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Fgd1P52734 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fgd1P52734 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fgd1P52734 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms