Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc4P51655 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc4P51655 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpc4P51655 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc4P51655 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gpc4P51655 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc4P51655 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms