Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csrp3P50462 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Csrp3P50462 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Csrp3P50462 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms