Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HpdP49429 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HpdP49429 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HpdP49429 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HpdP49429 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HpdP49429 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HpdP49429 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HpdP49429 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HpdP49429 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HpdP49429 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HpdP49429 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HpdP49429 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HpdP49429 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HpdP49429 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HpdP49429 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HpdP49429 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HpdP49429 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HpdP49429 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpdP49429 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpdP49429 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpdP49429 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HpdP49429 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HpdP49429 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HpdP49429 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HpdP49429 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HpdP49429 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HpdP49429 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HpdP49429 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HpdP49429 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HpdP49429 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HpdP49429 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HpdP49429 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HpdP49429 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HpdP49429 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HpdP49429 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HpdP49429 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HpdP49429 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HpdP49429 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HpdP49429 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HpdP49429 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HpdP49429 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpdP49429 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpdP49429 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpdP49429 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpdP49429 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpdP49429 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HpdP49429 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HpdP49429 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HpdP49429 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HpdP49429 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HpdP49429 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HpdP49429 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HpdP49429 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpdP49429 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpdP49429 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpdP49429 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpdP49429 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpdP49429 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HpdP49429 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HpdP49429 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HpdP49429 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HpdP49429 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HpdP49429 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HpdP49429 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HpdP49429 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HpdP49429 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HpdP49429 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HpdP49429 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HpdP49429 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HpdP49429 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HpdP49429 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HpdP49429 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HpdP49429 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HpdP49429 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HpdP49429 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HpdP49429 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HpdP49429 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HpdP49429 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HpdP49429 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HpdP49429 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HpdP49429 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HpdP49429 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HpdP49429 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpdP49429 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpdP49429 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpdP49429 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HpdP49429 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HpdP49429 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HpdP49429 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpdP49429 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpdP49429 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HpdP49429 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HpdP49429 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HpdP49429 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HpdP49429 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HpdP49429 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HpdP49429 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HpdP49429 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HpdP49429 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HpdP49429 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms