Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epb42P49222 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epb42P49222 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb42P49222 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb42P49222 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb42P49222 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb42P49222 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb42P49222 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb42P49222 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb42P49222 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb42P49222 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epb42P49222 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epb42P49222 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Epb42P49222 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb42P49222 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epb42P49222 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb42P49222 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb42P49222 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epb42P49222 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb42P49222 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb42P49222 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Epb42P49222 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epb42P49222 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epb42P49222 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms