Protein–RNA interactions for Protein: P48545

Kcnj5, G protein-activated inward rectifier potassium channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnj5P48545 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnj5P48545 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kcnj5P48545 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnj5P48545 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnj5P48545 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnj5P48545 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnj5P48545 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1808.7 ms