Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbx2P48031 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbx2P48031 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbx2P48031 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbx2P48031 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbx2P48031 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms