Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klf1P46099 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klf1P46099 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Klf1P46099 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf1P46099 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf1P46099 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf1P46099 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klf1P46099 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Klf1P46099 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Klf1P46099 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klf1P46099 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Klf1P46099 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klf1P46099 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms