Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdc2P43407 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sdc2P43407 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sdc2P43407 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sdc2P43407 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms