Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NodalP43021 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NodalP43021 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NodalP43021 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NodalP43021 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NodalP43021 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NodalP43021 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NodalP43021 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NodalP43021 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NodalP43021 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NodalP43021 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NodalP43021 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NodalP43021 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NodalP43021 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NodalP43021 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NodalP43021 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NodalP43021 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NodalP43021 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NodalP43021 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NodalP43021 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NodalP43021 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NodalP43021 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NodalP43021 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NodalP43021 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NodalP43021 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NodalP43021 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NodalP43021 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NodalP43021 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NodalP43021 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NodalP43021 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NodalP43021 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NodalP43021 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NodalP43021 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NodalP43021 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NodalP43021 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NodalP43021 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NodalP43021 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NodalP43021 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NodalP43021 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NodalP43021 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NodalP43021 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NodalP43021 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NodalP43021 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NodalP43021 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NodalP43021 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NodalP43021 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NodalP43021 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NodalP43021 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NodalP43021 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NodalP43021 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NodalP43021 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NodalP43021 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NodalP43021 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NodalP43021 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NodalP43021 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NodalP43021 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NodalP43021 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NodalP43021 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NodalP43021 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NodalP43021 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NodalP43021 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NodalP43021 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NodalP43021 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NodalP43021 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NodalP43021 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NodalP43021 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NodalP43021 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NodalP43021 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NodalP43021 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NodalP43021 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NodalP43021 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NodalP43021 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NodalP43021 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NodalP43021 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NodalP43021 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NodalP43021 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NodalP43021 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NodalP43021 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms