Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt4P40749 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt4P40749 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt4P40749 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt4P40749 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syt4P40749 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt4P40749 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt4P40749 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt4P40749 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syt4P40749 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syt4P40749 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syt4P40749 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt4P40749 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt4P40749 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt4P40749 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syt4P40749 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms